Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH16O75309 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH16O75309 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH16O75309 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH16O75309 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH16O75309 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH16O75309 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH16O75309 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH16O75309 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH16O75309 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH16O75309 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH16O75309 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH16O75309 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH16O75309 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH16O75309 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH16O75309 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH16O75309 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH16O75309 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH16O75309 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH16O75309 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH16O75309 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH16O75309 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH16O75309 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH16O75309 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH16O75309 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH16O75309 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH16O75309 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH16O75309 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH16O75309 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH16O75309 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH16O75309 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH16O75309 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH16O75309 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH16O75309 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH16O75309 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH16O75309 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH16O75309 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH16O75309 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH16O75309 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH16O75309 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms