Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPFIA3O75145 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA3O75145 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPFIA3O75145 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA3O75145 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms