Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
IGSF3O75054 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IGSF3O75054 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF3O75054 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms