Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX3O60493 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX3O60493 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX3O60493 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX3O60493 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX3O60493 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX3O60493 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX3O60493 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX3O60493 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX3O60493 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX3O60493 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX3O60493 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX3O60493 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX3O60493 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX3O60493 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX3O60493 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX3O60493 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX3O60493 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX3O60493 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX3O60493 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX3O60493 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX3O60493 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX3O60493 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX3O60493 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX3O60493 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX3O60493 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX3O60493 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX3O60493 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX3O60493 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX3O60493 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX3O60493 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX3O60493 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX3O60493 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX3O60493 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX3O60493 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX3O60493 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX3O60493 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX3O60493 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX3O60493 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX3O60493 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX3O60493 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX3O60493 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX3O60493 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX3O60493 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX3O60493 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX3O60493 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX3O60493 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX3O60493 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX3O60493 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX3O60493 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX3O60493 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX3O60493 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX3O60493 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX3O60493 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX3O60493 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX3O60493 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX3O60493 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX3O60493 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX3O60493 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX3O60493 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX3O60493 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX3O60493 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX3O60493 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX3O60493 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX3O60493 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms