Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC3O15379 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC3O15379 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms