Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUSKO15146 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUSKO15146 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUSKO15146 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUSKO15146 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUSKO15146 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUSKO15146 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUSKO15146 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUSKO15146 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUSKO15146 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUSKO15146 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUSKO15146 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUSKO15146 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUSKO15146 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUSKO15146 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUSKO15146 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUSKO15146 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUSKO15146 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUSKO15146 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUSKO15146 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUSKO15146 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUSKO15146 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUSKO15146 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUSKO15146 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MUSKO15146 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUSKO15146 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUSKO15146 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUSKO15146 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUSKO15146 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUSKO15146 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUSKO15146 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUSKO15146 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUSKO15146 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUSKO15146 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUSKO15146 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MUSKO15146 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUSKO15146 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUSKO15146 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUSKO15146 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUSKO15146 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUSKO15146 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUSKO15146 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUSKO15146 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUSKO15146 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MUSKO15146 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUSKO15146 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUSKO15146 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUSKO15146 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUSKO15146 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUSKO15146 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MUSKO15146 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUSKO15146 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUSKO15146 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUSKO15146 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUSKO15146 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUSKO15146 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUSKO15146 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUSKO15146 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUSKO15146 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUSKO15146 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MUSKO15146 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUSKO15146 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUSKO15146 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUSKO15146 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUSKO15146 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUSKO15146 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUSKO15146 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUSKO15146 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms