Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCLK1O15075 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DCLK1O15075 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms