Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
N4BP3O15049 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP3O15049 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
N4BP3O15049 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP3O15049 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms