Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFAB1O14561 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDUFAB1O14561 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFAB1O14561 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms