Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGRNO00468 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGRNO00468 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGRNO00468 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AGRNO00468 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGRNO00468 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGRNO00468 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGRNO00468 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGRNO00468 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGRNO00468 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGRNO00468 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGRNO00468 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGRNO00468 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGRNO00468 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AGRNO00468 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AGRNO00468 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AGRNO00468 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AGRNO00468 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AGRNO00468 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AGRNO00468 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms