Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RFXAPO00287 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFXAPO00287 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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