Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRK9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRK9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRK9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRK9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRK9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRK9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRK9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRK9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRK9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRK9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRK9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRK9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRK9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRK9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QRK9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QRK9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QRK9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRK9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRK9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRK9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRK9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRK9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRK9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRK9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRK9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRK9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRK9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRK9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRK9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRK9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRK9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRK9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRK9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRK9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRK9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRK9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRK9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRK9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRK9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRK9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRK9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRK9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRK9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRK9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRK9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRK9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRK9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
J3QRK9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRK9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRK9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRK9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRK9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QRK9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms