Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KR12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KR12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KR12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KR12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KR12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KR12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KR12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KR12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3KR12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3KR12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
J3KR12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
J3KR12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
J3KR12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
J3KR12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3KR12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3KR12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3KR12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3KR12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3KR12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3KR12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KR12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KR12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KR12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KR12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KR12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KR12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KR12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KR12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KR12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KR12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3KR12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3KR12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3KR12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3KR12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
J3KR12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
J3KR12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KR12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KR12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KR12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KR12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KR12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KR12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KR12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KR12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KR12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KR12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KR12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3KR12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3KR12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3KR12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KR12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KR12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms