Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms