Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PQ18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PQ18 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PQ18 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PQ18 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PQ18 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PQ18 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
E9PQ18 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PQ18 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PQ18 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PQ18 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PQ18 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PQ18 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PQ18 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PQ18 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PQ18 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PQ18 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PQ18 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PQ18 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PQ18 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PQ18 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PQ18 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PQ18 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PQ18 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PQ18 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E9PQ18 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E9PQ18 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PQ18 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PQ18 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PQ18 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PQ18 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PQ18 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PQ18 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PQ18 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PQ18 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PQ18 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PQ18 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PQ18 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PQ18 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PQ18 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PQ18 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PQ18 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PQ18 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9PQ18 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PQ18 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms