Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHMG1C9JSJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms