Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGB1P1B2RPK0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGB1P1B2RPK0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms