Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM3A6NDB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PALM3A6NDB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALM3A6NDB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms