Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT87PA6NCN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT87PA6NCN2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT87PA6NCN2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms