Protein–RNA interactions for Protein: A5D6W6

FITM1, Fat storage-inducing transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM1A5D6W6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FITM1A5D6W6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FITM1A5D6W6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms