Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHB12Q9Y5F1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms