Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB13Q9Y5F0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB13Q9Y5F0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB13Q9Y5F0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB13Q9Y5F0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB13Q9Y5F0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms