Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DTX4Q9Y2E6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX4Q9Y2E6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms