Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF6Q9Y252 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF6Q9Y252 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms