Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GABRQQ9UN88 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GABRQQ9UN88 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABRQQ9UN88 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABRQQ9UN88 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms