Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA8BQ9ULN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA8BQ9ULN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA8BQ9ULN7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms