Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCP2D1Q9UJQ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms