Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTNNA3Q9UI47 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTNNA3Q9UI47 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CTNNA3Q9UI47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNA3Q9UI47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms