Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXXC1Q9P0U4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CXXC1Q9P0U4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXXC1Q9P0U4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXXC1Q9P0U4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms