Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK12Q9NYV4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CDK12Q9NYV4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDK12Q9NYV4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms