Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSD3Q9NYI0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSD3Q9NYI0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD3Q9NYI0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms