Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNK4Q9NYG8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNK4Q9NYG8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNK4Q9NYG8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms