Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BARHL2Q9NY43 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BARHL2Q9NY43 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BARHL2Q9NY43 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.4 ms