Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT1Q9NXH9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRMT1Q9NXH9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRMT1Q9NXH9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms