Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SARS2Q9NP81 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SARS2Q9NP81 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms