Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BPIFA1Q9NP55 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA1Q9NP55 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BPIFA1Q9NP55 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BPIFA1Q9NP55 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms