Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDFQ9HBH1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDFQ9HBH1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDFQ9HBH1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms