Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTN4Q9HB63 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NTN4Q9HB63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms