Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCC1Q9HA90 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCC1Q9HA90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFCC1Q9HA90 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EFCC1Q9HA90 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms