Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DCLRE1BQ9H816 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCLRE1BQ9H816 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCLRE1BQ9H816 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms