Protein–RNA interactions for Protein: Q9H334

FOXP1, Forkhead box protein P1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP1Q9H334 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXP1Q9H334 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP1Q9H334 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXP1Q9H334 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms