Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDEL1Q9GZM8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NDEL1Q9GZM8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDEL1Q9GZM8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDEL1Q9GZM8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms