Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC27Q9C0I9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC27Q9C0I9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC27Q9C0I9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms