Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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