Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PCGF6Q9BYE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PCGF6Q9BYE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PCGF6Q9BYE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PCGF6Q9BYE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PCGF6Q9BYE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms