Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VPS25Q9BRG1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPS25Q9BRG1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms