Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CITED2Q99967 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED2Q99967 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms