Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPAS2Q99743 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms