Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNGAP1Q96PV0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNGAP1Q96PV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYNGAP1Q96PV0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.5 ms