Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGBD1Q96JS3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PGBD1Q96JS3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGBD1Q96JS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms